随着公众对健康问题的关注和意识的提高，特别是近年来公众批评的食品安全和健康问题，安全状况令人担忧。为了更好地控制食品安全和健康问题，中国还出台了相应的法律法规，对食品安全和健康法的违法行为进行监督、约束、避免和惩罚，并提出相关食品生产经营公司符合良好的净化车间生产规范要求。
为了使食品生产的整个过程不受微生物污染，对易变质的危害，将处理原材料、水、设备等，净化车间环境是否清洁也是一个重要条件，除了部分食品需要清洁无菌净化车间生产环境，如以下行业。
乳制品
无菌处理常用于酸奶、无菌牛奶或奶酪的加工以及德国香肠包装。一些大型设施需要100万级(ISO8级及9级以上。
灌装(饮料、饮料等)
啤酒、果汁和苏打水的无菌填充工艺增加了ISO5级(100级)和ISO洁净室6级(1,000级)。
在传统系统中，隧道巴氏法对商品进行了各种高温处理，获得的商品的物理特性发生了变化。相比之下，受控巴氏法的低热处理可以从几个方面提高产品质量。
净化车间生产的食品，由于其清洁度强，可以保证食品不被细菌粘附，但不能清除食品本身带来的细菌，因此也需要加热、药物、直接等方式。许多食品洁净室主要用于冷却、断开（片）、包装等工艺。